从整体上看，“全能神”组织作为邪教，其行为特征具体表现为：
一、诡异的运行模式
“全能神”组织是存在一种隐秘的亚文化群体，“全能神”人员并非由于其弱势，教徒们具有不同的价值观。这种文化的规范是同更大的社会的规范相背离的。
从“全能神”活动的形式看，它完全是地下邪教的运行模式。其传教如同传销一样，采用“人际关系网络滚动法”，单线联系。只管入教，不准问姓名，在交流中只称假名，如“小白”、“阿猪”等，每个教友只知道自己分号教会的几个人，教友聚会一般不超过7人；新加入者叫“新人”；被公安部门或政府部门发现叫“出环境”，被发现者要么不说，要么胡说；传教者一般不准带任何通讯工具，联系时，多变换用当地的话吧电话，有人接送和负责接待吃住，还给零花钱等。
二、组织严密
“全能神”组织具有严密的组织结构，呈金字塔式的结构模式。“全能神”组织内部组织体系十分严密，反侦察能力很强。在其内部组织体系中，最高者为女神，下设祭司，教会分大区-小区-分号教会，负责人叫“带领”；一个分号教会要求不超过50人，人增多后再分成新的分号教会，比如一号教会、二号教会、三号教会等，依此类推。其组织相当严密，分工相当细致。
“全能神”邪教组织头目赵维山2000年潜逃美国并获其政治庇护后，一直遥控指挥境内活动。今年以来，赵维山三次下发指令，宣称“现在大红龙惶惶不可终日，宗教界更是混乱不堪，国度福音扩展迎来了最佳时机”，要求“所有神选民必须担负起扩展国度福音的使命，全力配合圣灵作工”，教唆“三人一组包街传、包村传、包乡包镇传”。
另外，“全能神”对有明确的要求，为对信徒实行严格管控，“全能神”组织专门编写了内部使用手册《摸底铺路问题细则》。摸底，即他们的目的（知己知彼），铺路，就是与人拉好关系然后撒稗子。（以下简称《细则》）。如在在《细则》11页，其中采用卖狗皮膏药的口气，说：“抓住对方的情形，说一些适合他口味的话，作一些引起他注意的事”；“说话时务必别让他们看出咱们在撒谎……地址，姓名、年龄、家庭、教会、情况等等。事先编一地区并互相联系、报地址最好说明自己最熟悉的。”（《细则》第10页）；“可根据对方心理状态，利用他们的弱点对症下药，来维持与他们的关系。有的人追求哭，这时咱们哭得比他们哭得更要伤心，痛苦，能打动他们的心，这时的哭是为得着他们的信任。哭得让人感觉是出自内心的，不是装出来的”。（《细则》12-14页）；“对于受家庭逼迫，拦阻的，这时咱们（将自己）说得比他们更严重一些，让人听了口服心服，能让他们对咱们有好感。”（《细则》13页）。
三、行为暴力
这是“全能神”组织一个鲜明的行为特征。如故意杀人罪、故意伤害罪、强奸罪、抢劫罪、绑架罪等。如：家住亳州市谯城区的“全能神”成员刘玉祥在开展邪教组织、宣扬“末世基督”、“全能神”理论的过程中，向其信徒灌输“刘玉祥本人就是神，人要对神绝对服从”的思想。2004年4月至案发，被告人刘玉祥以上述迷惑、欺骗手段，对女信徒吴某某多次实施奸淫。后又以同样手段，对女信徒张某某、杨某、金某某等实施奸淫。本网站已经对其黑社会的性质也进行了相关报导（详见暴力招募信徒，全能神邪教对抗政府（图）——香港媒体：“全能神”邪教暴力招募信徒臭名昭著）。其他关于“全能神”暴力犯罪的事实不再一一列举。
四、疯狂敛财
“全能神”借“世界末日”等谣言大肆敛财的相关报导比比皆是，如2003年5月至11月，“全能神”成员刘玉祥采取让信徒缴纳“奉献金”的欺骗手段，诈骗信徒，敛聚钱财，金额达五万余元。又如近日在内蒙古自治区兴安盟边境地区落网的4名“全能神”成员，就专以留守老人为主要对象，散布“世界末日即将到来”的谣言，以“花钱买平安”为幌子，鼓吹“只有信教才能得救保平安”，诈骗群众大量钱财。居住在阿尔山市天池镇60多岁的吴老汉和老伴辛辛苦苦攒下的3000元钱全被“全能神”人员骗走。他们的诈骗钱财的行为进一步暴露了该组织的黑社会特征。另外，该邪教内部对资金控制严密。分号教会所用经费不能超千元，区教会不能超2万元，多余收入均要秘密上缴；信徒必须尽“本分”，所有信徒财产归“神家”；传教者与普通信徒同吃同住等等。
经济敛财既是“全能神”组织得以生存的基础，又是其行为的主要目标指向之一。“全能神”组织通过各种违法犯罪手段疯狂敛财，然后再使用这些钱财进行新的犯罪活动。
五、威胁恐吓
“全能神”邪教运用谎言、威吓、利诱等勾引人。在“全能神”教义的反复灌输下，它的信徒都信灾难将要降临，整天神经质，整天检查自己的“悖逆”，加上有病不医治的人比比皆是，导致许多信徒身体素质下降。一旦信徒出现思想不坚定或有退却行为时，他们就安排专人千方百计进行跟踪教育，力争“一个都不能少”。在不同的邪教组织之间，比如“全能神”与“门徒会”、“观音法门”等之间，相互争夺信徒，在邪教组织与宗教之间也争夺信徒，他们称此为“狼”抢“羊”，之间经常发生吊打、浇热水等伤害事件。另外，加入邪教的人，上不告父母，下不告子女，中不告夫妻。所以，各地被公安机关在对“全能神”成员实施营救和教育时，他们谁都不敢轻易说出自己的真实姓名和所在地，怕日后受到严厉害“教规”的惩罚。
再加上2012年12月21日是“世界末日”的说法在社会上有一定市场，“全能神”邪教组织便借一些人的恐慌心理抓紧公开“传福音”，拉人入教。
六、蛊惑群众
该组织宣扬耶和华统治的“律法时代”、耶稣统治的“恩典时代”已过去，“全能神”统治的“国度时代”已来临，神以一个东方女性的形象第二次道成肉身，降临中国，将对人类进行审判。并声称“世界末日就要来临”，只有信“全能神”才能得救，凡不信和抵制的都将被“闪电”击杀。还攻击称“当今中国是一个没落的帝王大家庭，受大红龙（指共产党）支配”，煽动信徒要在神的率领下与“大红龙”展开决战，“将大红龙灭绝，建立全能神统治的国度”。受此蛊惑，一些信众受“世界末日就要来临”，只有信“全能神”才能得救，凡不信和抵制的都将被“闪电”击杀的蛊惑，头脑中出现了“立即救人”的幻觉，从而产生杀人念头，并实施杀人的犯罪活动。据悉美国康涅狄格纽敦桑迪胡克小学校园枪击惨案和河南省校园杀人案就是受“世界末日”谣言影响而发。
七、势力猖獗
今年10月下旬以来，黑龙江、浙江、上海、河南、陕西、甘肃、青海、宁夏、新疆等21个省(自治区、直辖市)的l00多个地市多次发生“全能神”公开传教活动。特别是l2月5日以来，西北五省区和上海、河南等地尤为突出，多个地区发生“全能神”人员规模性聚集、公开打横幅宣扬“世界末日”事件，参加人数少则十几人、几十人，多则上百人。青海西宁、河南商丘等地还发生几十人甚至上百人到政府机关聚集滋事，要求释放被拘押人是的恶性事件。这些事例充分说明“全能神”势力猖獗。
