一、由海外总部直接向境内发布“开除敌基督的通告”。自女神和大祭司夫妻带着儿子流亡美国后，为能够有效遥控境内组织和施加影响力确保绝对权威，便定期向境内发布所谓的“上面的工作安排”、“上面的讲道交通”、“生命进入的原则”以及各种“通知”、“通报”。此种“通知”或“通报”，主要分三种类别，或是信徒见证、或是女神嘉奖、或是组织惩戒令，一般半年下发一次，传至基层教会和二线传福音等次。据悉，2007年大祭司就是通过“敌基督的通告”将盛名一时的监察组长何哲迅玩掉的。最近的“敌基督的通告”是2012年3月份的第16号、2012年11月份的第1325号，分别将淮安区级带领沈某某、浙闽牧区带领带领庄某某开除。
二、挑动境内各层级内部相互揭发掣肘，以便从中驾驭。原淮安区级带领沈某某就是遭内部检举后被开除的。2011年6月，淮安区小区带领检举该大区带领沈某某提拔恶人做二线指挥，后沈某某打击报复，将“检举她的人提到区里去打假”。据开除通告的说法，沈某某是“三无之人”，即“成了犹大无懊悔、残害人良心无知觉、无有敬畏神之心”。2012年3月，沈某某就被以“偷吃祭物”的罪名开除出教会了。
三、定期不定期开展清理整顿活动。最新一次清理整顿是在2012年3月开始的，为期半年。该年3月15日，邪教全能神下发工作安排，题为“彻底清理教会生活神末世作工的最后步骤”，明令开除五种人，即敌基督、恶人、邪灵作工的人、贪占和出卖神祭物的人以及叛徒犹大。并声称，“浙闽区必须开除的人数是四百人左右，每个牧区起码开除三百人以上”，“每个牧区必须开除三四百人才是真正达到清理教会的实际指标”。且该组织对在清理过程中，不得力的带领或办事员采取撤换和淘汰。而对于出过环境或被政府教育审查的信徒，必须在教会内部见证情况下，双膝跪地，用全家人的身家性命向“神家”诅咒和发毒誓表忠心。
四、对女神的话只能俯首帖耳的信，禁止有质疑反对的声音。在全能神下发的工作安排中可以看到：“只有实际高举神、见证神达到真实事奉神的150条真理”，罗列了神选民必须遵守的十七条诫命，其中有：不可论断神的作工；不可模仿神的说话口气、说话目的；对今天身的所有作工都顺服，即使不明白也不得论断；不可越过神的原有地位，只能站在人的角度上事奉今天的神，不能站在人的角度上来教导今天的神。
在邪教全能神内部，信徒就是逆来顺受的奴仆，女神则是高高在上的蛮横主宰，难有基督教的弟兄姊妹的情谊。
