危害之一：扰乱了人们的信仰与精神追求。宗教是一种社会文化的继承，每个人都有精神信仰的心理需求，这种特定文化和时代背景下的神秘信仰，如果引导不好，就可能演变成为邪教或极端信仰团体。
全能神打着基督教的旗号，断章取义，曲解《圣经》、歪曲教义，大量引用《圣经》内容，几乎每一个章节、每一篇“神话”都引用《圣经》教义及典故，逐步形成了自己一套系统的邪说“理论体系”，反过来又通过贬损宗教的声誉来宣扬和抬高自己，他们所传讲的信息却与基督教的教义完全不同，意义甚至相反。
在基督教思想中，《圣经》是正统基督教公认的权威性经典，在《圣经》之外，神不再给任何人有新的默示，而全能神这些所谓的“神的话”，就是赤裸裸对《圣经》的诋毁，充分暴露出全能神的癫狂本性。基督宗教都有关于来世的信仰认同，作为假冒基督之名的全能神，同样强调对来世的选择与救赎的认信，可解读的含义却大相径庭，邪教全能神以“神话”故弄玄虚，反复对信徒灌输洗脑。
这些歪理邪说，完全是颠倒黑白，混淆是非，鱼目混珠，欺骗了一批善良的群众，使一些没有宗教知识的人上当受骗，结果那些受迷惑的人只能盲目地跟从假师傅所传讲的假经文，奔走在一条既错谬又危险的道路上，并将这些邪说作为宗教信仰来加以接受、崇拜，一步步误入歧途，走上邪路，上了邪船，最后彻底被洗脑，失去了判断是非美丑的能力，掉入泥潭，越陷越深，难以自拔，从此走上了不归路，有的断送了美好前程，有的搞得妻离子散，家破人亡，有的断送了卿卿生命……
危害之二：影响了教会正常活动与信誉。任何宗教，都有其庄重的活动仪式和内容，而全能神假借基督教“做功课”，实质为“洗脑”，假借基督教“传福音”，实质是发展成员、卧底“抢羊”等。
这样的强盗行径给教会带来的后果是：本来在一起聚会的兄弟姐妹因而彼此不来往了，中了害的人把其他兄弟姐妹视为仇敌。如我们去劝勉一个受迷惑的姐妹时，她说：“我恨死你们这些人了！”本来在一起事奉天主的教友中，受了迷惑的教友甚至攻击神父是“抵挡天主、亵渎圣神的法利塞人”。受迷惑的教友拒绝和神父、教友见面，……类似可悲的现象不胜枚举。不仅损害了天主教的正教形象，而且严重影响到了合法宗教活动的正常开展。
危害之三：破坏了家庭的完整与天伦之乐。这种假道对受迷惑者的家庭的危害与破坏是极大的。那位“女基督”教导人说：“为你那污鬼爹娘奔波忙碌到现在，你竟然不知道坑害你的，竟是生你养你的污鬼爹娘；你更不知道你的污秽竟然是他供应给你的…”。“所以说得背叛肉体，不能体贴了它，什么丈夫、妻子、儿女、前途、婚姻、家庭这些都没有！”“我心里只有神，我得好好地满足神，不能满足肉体，你有这个心志才行。”满嘴荒唐，一派胡言，却迷惑了不少痴迷的信徒。
最近，凯风网应网友求助，刊发了寻人启事《寻找被全能神拐走的单淑梅女士（图）》。1964年11月生的单淑梅现户籍地北京市，2011年误入邪教全能神，逐渐痴迷。2014年11月9日在全能神邪教裹挟下离家出走，已“失踪”19个月。去年5月，《凯风网》独家曝光了一封全能神信徒写给家人的《断绝子女关系书》。从中可以看出，受毒害的全能神信徒曾金梅为了表达对全能神忠诚，决定断绝与3个子女的母子关系，其完全丧失了人的情感，失去了女性的母爱，已成了一个活脱脱的行尸走肉僵体。还有网友陈琦发表《端午节：八个难以团圆的家庭（组图）》（凯风网2016-06-08），讲的是8个全能神信徒“舍家弃亲，专门去‘传福音’、‘为神作工’去了”，实际上都是被全能神邪教“拐跑了”、裹挟控制了。
危害之四：影响了社会的和谐与长治久安。全能神的邪恶及危害，不仅体现在是一种“败坏当代中国劳动伦理、家庭伦理、婚姻伦理的‘道德邪教’”，“全盘否定中国传统文化，取消当代中国核心价值体系的‘文化邪教’”更是一种“聚敛钱财、残害生命、祸害家庭、破坏生产的‘社会邪教’”。总之，全能神就是破坏社会的一个恶性毒瘤，必须予以根治和铲除，否则后患无穷。
无数血淋淋的事实已告诉人们：全能神邪教就是一个破坏安定，肆意残害生命的毒瘤，其行径就是一个活脱脱黑社会组织。他们肆意从事非法拘禁、伤害、绑架等暴力犯罪活动，甚至公然假冒国家机关人员为非作歹。2010年河南一名小学生死于一柴垛处，脚心印有闪电标志，经调查得知，这是全能神对儿童家长意图脱教的惩戒行动。安徽省霍邱县的郭凯称，舅妈在加入全能神后不久发现上了当，就表示不想参加该教的活动了，可全能神却恐吓相逼:“你要是不干了，神一定会惩罚你的，灭了你和你的家人，包括你的孙子!”舅妈最终被逼投水自尽。
为了掩人耳目，全能神还给自己的暴力行为用了一些很专业的名词，如“审判”、“管教”，用以美化自己的罪恶与暴行。
全能神的种种恶行，真是罄竹难书。正如路德莱斯学院(现在是路德莱斯大学)、西方知名记者和电台脱口秀主持人马克·麦吉（MarkMcGee）下的结论那样“全能神是一个危险的邪教”、“ 基督徒们应当小心这个邪教，以免受到身心的伤害”。
